Hay dos riesgos al poner los frenos hidráulicos al revés.
El sistema de frenos no está lleno hasta rebosar de líquido hidráulico: es probable que haya una pequeña burbuja de aire. Normalmente, ésta se encuentra en el punto más alto del sistema: el depósito de aceite de la palanca de freno. Allí, no es comprimido por el pistón cuando se frena, por lo que no puede interferir con el frenado. Si se sube a la bicicleta, las burbujas de aire pueden viajar a través del sistema hasta las pastillas de freno. Si no logran llegar al depósito antes de que quieras frenar, es posible que los frenos estén más blandos de lo normal. 15 minutos es tal vez una estimación pesimista, y no es un gran riesgo a menos que te subas a la moto y de inmediato necesites frenar muy fuerte.
El otro problema potencial es si los sellos del depósito de aceite no están muy apretados. Puede que no lo notes en el uso normal, porque están en la parte superior, pero cuando están en la parte inferior del sistema, la presión podría dejar salir algo de líquido de frenos. Si notas que esto ocurre, deja de girar la moto al revés y asegúrate de comprobar que aún tienes suficiente líquido para frenar correctamente. Si sigue ocurriendo después de haber vuelto a apretar el sello, es posible que tenga que cambiar el o los ojales de goma. A menudo los sellos de goma se disuelven con el tiempo por el aceite, y dejan de hacer su trabajo correctamente.
Como otros han dicho en los comentarios, sería mejor que evitara la necesidad de poner su bicicleta al revés. Encuentra dónde entra el agua en el cuadro y sella cualquier hueco. Algunas bicicletas ya vienen con agujeros en la parte inferior en caso de que necesiten drenar, y podrías considerar añadir los tuyos propios.